El Reglamento, que consta de 8 parrafos y 4 anexos, se propone prevenir la introducción, evitar la propagación y erradicar las enfermedades epizootiologicamente graves de los organismos acuáticos. Asimismo, garantizar la aplicación del Sistema de Vigilancia Epizootiológica, y de forma particular la notificación inmediata de enfermedades u otros factores que afecten la salud de los organismos acuáticos.